热烈祝贺实验室林玉祥副主任医师团队在国际期刊Computational and Mathematical Methods in Medicine上发表了题为"Identification of Pulpitis-Related Potential Biomarkers Using Bioinformatics Approach "的期刊论文。

该文章基于 Gene Expression Omnibus（GEO）数据库，研究发现了843个与牙髓炎有关的差异表达基因（DEGs）。之后，通过构建 DEGs 的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，并使用 MCODE 插件来确定关键功能子集。同时，对关键功能子集中的基因进行了 GO 和 KEGG 富集分析。结果表明，这些基因主要富集在与炎症反应相关的功能中。接下来，筛选出 PPI 网络节点和牙髓炎相关基因的交叉点。然后得到20个基因作为种子基因。在 PPI 网络中，用随机行走重启法（RWR）筛选出与种子基因相关度最高的50个基因。此外，从前50个基因和关键功能子集的基因的交叉点得到4个与牙髓炎相关的中心基因。最后，利用 GeneMANIA 预测与枢纽基因共表达的基因，并根据 GEO 数据分析了4个枢纽基因在正常组和牙髓炎组的表达水平。结果表明，这4个枢纽基因主要与化疗相关基因共表达，并且在牙髓炎组中明显高表达。文章最终确定了4个潜在的牙髓炎的标记基因。